Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNDC1Q96C34 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNDC1Q96C34 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNDC1Q96C34 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNDC1Q96C34 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNDC1Q96C34 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNDC1Q96C34 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms