Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SPTSSAQ969W0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SPTSSAQ969W0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SPTSSAQ969W0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SPTSSAQ969W0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SPTSSAQ969W0 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SPTSSAQ969W0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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