Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms