Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE8

TTC16, Tetratricopeptide repeat protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC16Q8NEE8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTC16Q8NEE8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TTC16Q8NEE8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TTC16Q8NEE8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TTC16Q8NEE8 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TTC16Q8NEE8 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TTC16Q8NEE8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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TTC16Q8NEE8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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TTC16Q8NEE8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC16Q8NEE8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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