Protein–RNA interactions for Protein: Q8N431

RASGEF1C, Ras-GEF domain-containing family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1CQ8N431 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RASGEF1CQ8N431 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RASGEF1CQ8N431 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RASGEF1CQ8N431 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RASGEF1CQ8N431 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RASGEF1CQ8N431 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RASGEF1CQ8N431 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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