Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms