Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IGDCC3Q8IVU1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms