Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6L0

PRRT2, Proline-rich transmembrane protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT2Q7Z6L0 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRRT2Q7Z6L0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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