Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms