Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLRC1Q6VVB1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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