Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC9A4Q6AI14 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms