Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DUPD1Q68J44 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms