Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SAMD13Q5VXD3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms