Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AGAP9Q5VTM2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms