Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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