Protein–RNA interactions for Protein: Q30KQ1

DEFB133, Beta-defensin 133, humanhuman

Predictions only

Length 61 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB133Q30KQ1 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFB133Q30KQ1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
DEFB133Q30KQ1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFB133Q30KQ1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFB133Q30KQ1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFB133Q30KQ1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFB133Q30KQ1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFB133Q30KQ1 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFB133Q30KQ1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DEFB133Q30KQ1 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms