Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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COL24A1Q17RW2 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COL24A1Q17RW2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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