Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms