Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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