Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNHIT3Q15649 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms