Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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LAPTM4AQ15012 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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