Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms