Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHD4Q14839 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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