Protein–RNA interactions for Protein: Q14669

TRIP12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP12Q14669 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP12Q14669 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms