Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRIM25Q14258 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms