Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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CUL4AQ13619 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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