Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE3BQ13370 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms