Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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ANK3Q12955 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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ANK3Q12955 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ANK3Q12955 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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