Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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