Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SREBF2Q12772 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SREBF2Q12772 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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