Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms