Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms