Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SOS1Q07889 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms