Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTDSPL2Q05D32 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTDSPL2Q05D32 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms