Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYP27A1Q02318 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms