Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNTN2Q02246 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNTN2Q02246 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNTN2Q02246 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNTN2Q02246 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNTN2Q02246 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms