Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CBX1P83916 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CBX1P83916 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CBX1P83916 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX1P83916 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms