Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 HACL1-206ENST00000435217 1269 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 ADAL-204ENST00000562188 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 FP565260.4-201ENST00000624081 513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSEN1P49768 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms