Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC4A3P48751 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms