Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLMP48507 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLMP48507 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCLMP48507 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCLMP48507 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms