Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RECQLP46063 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RECQLP46063 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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