Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNGA1P29973 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms