Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCSK1P29120 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms