Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FGFR3P22607 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms