Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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