Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RASA1P20936 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RASA1P20936 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RASA1P20936 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RASA1P20936 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RASA1P20936 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RASA1P20936 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RASA1P20936 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RASA1P20936 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RASA1P20936 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RASA1P20936 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RASA1P20936 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RASA1P20936 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RASA1P20936 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RASA1P20936 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RASA1P20936 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RASA1P20936 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RASA1P20936 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RASA1P20936 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RASA1P20936 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RASA1P20936 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RASA1P20936 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms