Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms