Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TCP1P17987 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TCP1P17987 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TCP1P17987 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCP1P17987 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCP1P17987 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCP1P17987 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCP1P17987 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCP1P17987 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCP1P17987 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCP1P17987 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCP1P17987 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCP1P17987 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCP1P17987 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TCP1P17987 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCP1P17987 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCP1P17987 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCP1P17987 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TCP1P17987 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms