Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHGAP10645 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHGAP10645 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHGAP10645 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHGAP10645 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHGAP10645 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHGAP10645 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHGAP10645 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHGAP10645 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHGAP10645 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHGAP10645 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHGAP10645 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHGAP10645 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHGAP10645 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHGAP10645 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHGAP10645 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHGAP10645 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms