Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
IGKV3-15P01624 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms